阵容搭配的核心在于平衡舰船类型与功能定位。一套合理的舰队需要兼顾前排抗伤、中后排输出、防空能力以及特殊场景的适应性。舰船分为护卫艇、驱逐舰、巡洋舰、战列巡洋舰和航空母舰等类型，每种类型在战斗中扮演不同角色。前排通常由高护甲或高闪避的舰船承担，例如FG300装甲型或奇美拉级巡洋舰；中后排则优先选择火力强劲的舰船，如卡利斯托或红宝石级。防空能力依赖于光锥级或枪骑兵防空型舰船，而载机舰船则需搭配强力舰载机以发挥最大效果。舰队搭配并非固定模板，需根据敌方阵容和战场环境动态调整。
舰船的站位与战斗序列是影响胜负的关键因素。前排舰船需要承受大部分伤害，因此防御属性至关重要；中后排舰船则应专注于输出或辅助功能。战斗序列决定了舰船的攻击优先级，例如某些武器会优先攻击护卫舰或驱逐舰，因此在搭配时需考虑敌方舰船类型。若敌方以小型舰船为主，可增加对小型舰船特攻的舰船；若敌方舰载机较多，则需强化防空能力。舰船的移动速度也需注意，低速舰船可能拖累整体舰队机动性，尤其在围剿或撤退时影响战术执行。
平民玩家在资源有限的情况下，需优先选择性价比高的舰船。FG300装甲型、CAS066级巡洋舰和ST59级战列巡洋舰是常见的前排选择，获取难度较低且实用性较强。中排可搭配枪骑兵或全能级离子炮巡洋舰，后排则推荐AC721载机型或KCCPV2.0轻型攻击巡洋舰。护航艇和战机方面，系统赠送的CV-II003或CV-M011重型导弹艇是不错的过渡选择，而蜂巢、维塔斯B010等高级舰载机则需通过蓝图研究获取。平民阵容的核心思路是以最小资源消耗实现最大战斗效能，避免与高配置舰队正面冲突。
同盟作战与攻城玩法对舰队搭配提出更高要求。在攻城时，需优先消灭城市守卫舰队，因此舰队需具备持续作战能力。有奶船的舰队应优先上场，以减少战损；无奶船的舰队可稍后参战或采用增援策略。同盟战中，高速抄家舰队能有效破坏敌方前哨站和采矿平台，通常由诺玛M470和云海级组成，搭配高机动护卫舰。防守时则需注重舰队联防，利用数量优势夹击敌方舰队。星系态势任务要求玩家协同完成，因此舰队搭配需兼顾个人需求与团队贡献。
没有绝对无敌的阵容，只有适应环境的搭配。舰船的强度受技术点分配、蓝图研究和实战经验影响，因此玩家需不断优化舰队配置。前期以资源积累和基础舰船培养为主，中后期逐步转向高价值舰船的组合。战术灵活性比固定阵容更重要，根据敌方动向调整舰队构成才能占据主动。阵容搭配的成败取决于玩家对游戏机制的理解和临场应变能力。
